系統代理主要影響遵循系統代理設定的應用，部分遊戲、命令列工具、商店應用和獨立代理軟體可能不會讀取它。命令列工具設定 HTTP_PROXY 或 HTTPS_PROXY，支援手動代理的應用填寫 mixed-port，其餘應用再考慮 TUN。
應用讀取的是系統代理、獨立連接埠還是都沒有
系統代理開啟後，用瀏覽器確認本機連接埠工作，再觀察目標應用是否出現在連線清單；未出現說明它沒有讀取系統代理。
- 瀏覽器是否使用自己的代理擴展
- 命令列工具是否需要 HTTP_PROXY 或 HTTPS_PROXY
- 應用是否只支援 SOCKS 或只支援 HTTP 代理
- 用戶端本機連接埠是否和應用設定一致